Mit Oligonucleotiden gegen COVID-19
Mit Oligonucleotiden gegen COVID-19
Über die Synthese, Scale-up und Sequenzbestätigung
Das britische Unternehmen ATDBio ist darauf spezialisiert, qualitativ hochwertige Oligonucleotide für anspruchsvolle Anwendungen herzustellen, einschließlich für COVID-19-Testkits. Um die Nachfrage nach Oligonucleotiden seit Pandemiebeginn zu bedienen, hat ATDBio seine Produktion erweitert und nochmals mehrere LC-Systeme von Shimadzu erworben. Das ermöglicht ATDBio, Oligonucleotide in unterschiedlichen Maßstäben zu synthetisieren – von kleinsten bis zu sehr großen Mengen an Primern und Sonden für COVID-19-Tests – und wird so auch weiterhin einen signifikanten Beitrag zur Bekämpfung der Pandemie leisten.
Synthetische Oligonucleotide, kleine Abschnitte von Einzelstrang-DNS und -RNS, hergestellt über eine chemische Synthese, haben eine wichtige Bedeutung in der Molekularbiologie, der Genetik, der Medizin und darüber hinaus. Als Hauptkomponenten in COVID-19-Testkits haben sie für Aufmerksamkeit gesorgt.
Effektive Lösungen für komplexe Probleme
ATDBio, mit Sitz in Southampton und Oxford, nimmt wahr, wie sich das Tätigkeitsfeld des Unternehmens seit Beginn der Pandemie verändert. Dr. Tom Brown jun., Leiter von ATDBio, erklärt: „Alle gegenwärtigen genetischen COVID-19-Testverfahren benötigen synthetische Oligonucleotid-Primer und -Sonden. Wir unterstützen unsere Kunden aus Kliniken und Privatunternehmen, einfachere, schnellere und genauere diagnostische Verfahren zu entwickeln. Wir wurden seit Beginn der Pandemie mit Anfragen überschwemmt, und wir fahren unser Oligonucleotid-Synthesepotenzial drastisch hoch, um die Nachfrage zu decken.“
Ian Tear, leitender Produktionswissenschaftler, ergänzt: „Wir haben die Flexibilität und das Wissen, unsere Produktionsprozesse den Bedürfnissen unserer Kunden anzupassen. Wir sind stolz darauf, einfache, effektive Lösungen für komplexe Probleme zu finden, die es unseren Kunden erlauben, sich auf ihre Forschung zu konzentrieren.” Dieses Wissen und tiefe Verständnis um die Nukleinsäurechemie sowie die jahrelange Erfahrung sind wesentliche Gründe, weshalb ATDBio bei der kundenorientierten Oligonucleotidsynthese gefragt ist.
Der Ruf von Shimadzu hinsichtlich Robustheit und Langlebigkeit der Produkte sowie Innovationsstärke und Kundenservice waren für ATDBio entscheidend, Nexera Prep LC-Systeme für seinen Produktionsablauf auszuwählen.
Dr. Brown: „Fast in jedem Labor, in dem ich gearbeitet habe, scheint ein bewährtes UV/Vis-Spektrometer noch immer ohne Probleme seine Dienste zu tun. Ich erinnere mich auch, dass ich als Student 2002 vom Gewinn des Nobelpreises für Shimadzu gelesen habe. Später besuchten wir das Shimadzu-Labor in Milton Keynes, trafen einige Mitarbeiter und waren von ihrem Fachwissen beeindruckt, der Bereitschaft, unsere Herausforderungen zu verstehen, und der Fähigkeit, für uns ein System zu finden, das ideal zu unserem Bedarf passt. Das Verständnis von Shimadzu für unsere Bedürfnisse, zusammen mit der Lieferung und Unterstützung einer zuverlässigen Lösung, übertrafen jede unserer zuvor gemachten Erfahrung.“
Dr. Brown fügt hinzu „Im Rahmen unserer jüngsten Erweiterung haben wir zusätzliche LC-Systeme von Shimadzu angeschafft. Wir synthetisieren Oligonucleotide in unterschiedlichen Maßstäben, von sehr kleinem Umfang für Forschungszwecke bis zu sehr großen Mengen an qPCR sowie LAMP-Primern und -Sonden für COVID-19-Tests. Fähig zu sein, zuverlässig über eine große Bandbreite von Synthesemengen zu arbeiten, ist für uns essenziell.“
Schnelle Analyse von Nanokonstrukten mit minimaler Probenaufreinigung
ATDBio engagiert sich auch maßgeblich in Forschung & Entwicklung, was das Unternehmen als wesentlich ansieht, um an der Spitze im Segment Nucleinsäuren zu bleiben. Dr. Brown: „Zu jeder Zeit sind wir in verschiedene Forschungsprojekte eingebunden. Ein aktuelles beinhaltet die DNS-Nanotechnologie, die Oligonucleotide als Baumaterialien einsetzt, um große DNS-Nanokonstrukte zu erzeugen, die das Potenzial zum Wirkstoffanwendungssystem haben.”
ATDBio setzt komplementäre Analysetechniken ein. Wenn das Material allerdings knapp ist, oder eine DNS enthält in hohem Maße Sekundärstrukturen, hat ein hohes Molekulargewicht oder weist Komponenten wie Salze oder Proteine auf, die eine LC oder MS stören, ist eine MultiNA das Gerät der Wahl. MultiNA ermöglicht eine hoch-reproduzierbare Analyse von DNS RNS durch ihre automatisierte Mikrochip-Elektrophorese. Der im DNS-Robotikprojekt über die Marie Skłodowska-Curie-Initiative geförderte Nachwuchswissenschaftler Quentin Vicentini ergänzt: „Eine MultiNA erlaubt, Nanokonstrukte schnell mit minimalem Probenaufreinigen zu analysieren. Sie liefert einen schnellen, reproduzierbaren und hochauflösenden Nachweis, dass ein Experiment funktioniert hat, bevor fortgefahren wird – anstatt auf einen Gel-Durchlauf zu warten.“
ATDBio wird weiterhin dazu beitragen, die COVID-19-Pandemie zu bewältigen sowie die Bereitschaftsplanung für zukünftige Ausbrüche zu verbessern. Dabei spielt auch Shimadzu eine Rolle.
